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预印本 · 单细胞与空间组学· Paik H.·· 1 天前AI 评分51

GOLDEN结合基因表达与等位基因信息,解析空间转录组中的遗传异质性

GOLDEN: Gene expression and allele-informed decomposition for genetic heterogeneity in spatial transcriptomic data

AI 导读

研究团队开发GOLDEN,结合基因表达与等位基因信息,识别空间转录组各位点的目标、非目标或混合身份,并估计目标细胞比例。该方法采用等位基因感知的多任务网络,在基于半同种异体单细胞表达谱构建、具有位点级真值的合成数据中,比例估计达到Pearson's r = 0.977,平均绝对误差(MAE)= 0.045;在真实空间转录组数据中的预测表现一致,并获得遗传学验证。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org