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预印本 · 单细胞与空间组学· Paszek J, Mykowiecka A, Gogolewski K.·· 1 天前AI 评分41

基于纵向单细胞拷贝数谱、考虑活检采集顺序的系统发育重建

Biopsy-aware phylogenetic reconstruction from longitudinal single-cell copy number profiles

AI 导读

Cancer Tree Biopsy Framework(CTBF)提出利用活检采集顺序的癌症系统发育重建方法,在100个独立模拟历史中,部分树方法的平均相似度高于合并样本的邻接法和仅用拓扑的MEDICC2。对KTN152三次纵向活检的应用展示了该方法处理患者来源整数拷贝数估计的全基因组可行性。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org