预印本 · 单细胞与空间组学· Liu H, Mao S, Gallent T, Chen Y, Yan Z, Vogel I, Traunmuller L, Zhang R, Buenrostro JD, Zhou J, Greenberg ME.·· 1 天前AI 评分51
Bolero 从 DNA 预测跨物种、细胞状态特异性的基因调控
Predicting cell-state-specific gene regulation from DNA across species
AI 导读
研究团队开发 Bolero,将细胞图谱尺度的状态嵌入及其他生物学变量作为条件,从 DNA 预测细胞状态特异性的染色质可及性和转录本丰度。模型使用六种哺乳动物、33 个数据集的 10.7 million 个细胞训练,表现达到或超过专用模型,并可预测训练中未包含的细胞状态和物种,以及无需实际刺激数据的 AP-1 活性相关染色质变化。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org