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预印本 · 单细胞与空间组学· Oterino-Sogo S, Mechkouri N, Garcia-Ruano D, Groppi A, Rezvani H, Nikolski M.·· 2 天前AI 评分46

SpaceBlocks:用于队列级空间转录组学分析的专家监督工作流

SpaceBlocks: an expert-supervised workflow for cohort-level spatial transcriptomics analysis

AI 导读

SpaceBlocks是一种基于Snakemake的专家监督工作流,可统一多平台数据格式,支持可重复的队列级单细胞分辨率空间转录组学分析。对Visium HD、Xenium 5K及MERSCOPE公共数据集37份样本的再分析显示其跨平台处理可扩展性,并识别出此前遗漏的细胞类型及异质性标志基因表达。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org