ARCADE在空间转录组学中解耦细胞丰度与连续转录状态

ARCADE计算框架将空间转录组中的细胞丰度与连续转录状态解耦，在模拟及半合成基准测试中提高了解卷积准确性和状态推断稳定性。该框架先构建稳健的单细胞参考，再估计细胞类型组成并建模类型内转录程序。在配对的人背外侧前额叶皮层数据中，ARCADE区分了局部细胞富集与星形胶质细胞、小胶质细胞的活化程序。