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预印本 · 单细胞与空间组学· Zhang D, Jiang Y, Yu X, Bai D, Tian J, Enninful A, Tian X, Li H, Huo Y, Chen Y, Yao N, Li J, Chu Z, Bai Z, Fan R, Lu J, Gerstein M.·· 2 天前AI 评分41

StarTrak:在空间基因组学中高分辨率推断细胞谱系与迁移

Determining cellular phylogeny and migration at high resolution in spatial genomics

AI 导读

StarTrak整合突变证据与空间信息,实现单像素空间分辨率的体细胞变异检测和谱系重建,用于推断细胞迁移。该框架结合神经网络、组织学图像及转录组状态,在多种组织和空间组学平台上表现稳健,尤其适用于空间ATAC-seq。肿瘤和皮肤切片分析分别提示突变细胞向邻近非恶性组织及皮肤深层迁移。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org