预印本 · 单细胞与空间组学· Sakai SA, Nomura R, Ohira M, Kurihara K, Chi S, Matsubara Y, Morinaga Y, Kato T, Takeda-Miyata N, Kojima M, Sakashita S, Ebi H, Yamaguchi R, Oki E, Fujisawa T, Bando H, Suzuki A, Suzuki Y, Tsuchihara K, Kageyama S, Yamashita R.·· 1 天前AI 评分50
SPATNIC 基于 H&E 病理标注实现结直肠癌跨空间与单细胞转录组平台的癌细胞识别
SPATNIC enables H&E-grounded cancer-cell identification across spatial and single-cell transcriptomic modalities in colorectal cancer
AI 导读
SPATNIC 是一种变分自编码器，利用配对 H&E 图像经病理医师标注的 Xenium 细胞训练，在结直肠癌中区分癌细胞与正常细胞。其在原发肿瘤及肝、肺转移灶中的表现达到或超过现有工具，并可零样本泛化至 Visium、Visium HD、CosMx、Xenium、MERSCOPE 和单细胞 RNA 测序。
来源：预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org