预印本方法与工具空间转录组建模方法研究
空间转录组学中的生物学与技术性空间变异
Biological and technical spatial variation in spatial transcriptomics
提出 stipple,将空间可变捕获纳入突发式转录模型,以区分生物学变异与空间技术噪声。
新的分析方法、软件、数据库与实验方案:解决什么问题、怎么用、和现有方法比怎样。
Biological and technical spatial variation in spatial transcriptomics
提出 stipple,将空间可变捕获纳入突发式转录模型,以区分生物学变异与空间技术噪声。
Near-infrared photochromic miniprotein enables photoacoustic molecular imaging of acute inflammation and intracellular antigens.
开发了微型光开关探针rsmiRFPnano,用于急性炎症与细胞内抗原的活体光声分子成像。
Serval: a modular framework for decoding imaging based spatial transcriptomics data.
提出模块化解码框架 Serval 及 CoSiD 算法,支持跨平台基准评测并提高转录本检出。
STiLE: automated tissue microarray dearraying for spatial transcriptomics.
提出仅依赖细胞质心坐标的STiLE,自动将空间转录组组织微阵列中的细胞分配至各组织芯。
Tissue expansion mass spectrometry imaging (TEMI) for high-spatial-resolution multiomics molecular mapping.
提供TEMI实验方案,通过组织物理膨胀提升常规质谱成像分辨率,实现单张组织切片的多组学分子定位。