预印本实验研究小鼠疫苗免疫与抗体谱系研究
HIV-1糖链屏障的异源糖基化促进跨进化枝中和及多样化人抗体谱系的产生
Xenoglycosylation of the HIV-1 Glycan Shield Promotes Cross-Clade Neutralization and Diverse Human Antibody Lineages
在小鼠中，携带核心α(1,3)-岩藻糖的Env免疫原可诱导跨进化枝中和抗体应答。
文献解读
从数据分析和研究设计的角度读新论文：数据从哪来、流程怎么走、用了什么工具、哪里值得学。
Nature Protocols方法与工具单细胞DNA甲基化测序实验方案
用于全基因组DNA甲基化谱分析的多重单细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序
Multiplexed single-cell reduced representation bisulfite sequencing for genome-wide DNA methylation profiling.
提出Msc-RRBS实验方案，可并行分析数百个单细胞的DNA甲基化谱，研究细胞间异质性。
Cell数据分析小鼠运动多组学图谱研究
长期运动的多组学图谱
Multi-omics atlas of chronic exercise.
在小鼠中，长期运动引起组织、性别和昼夜时相特异的分子重塑，单核多组学揭示细胞类型特异变化。
预印本方法与工具单细胞甲基化偏倚校正与基准评测
减轻基因型驱动的偏倚可改善图谱规模的单细胞DNA甲基化分析
Mitigating genotype-driven bias improves atlas-scale single-cell DNA methylome profiling
提出屏蔽变异位点的策略，减轻单细胞DNA甲基化分析中的基因型混杂。
Med数据分析II期试验队列多组学分析
肿瘤DNA甲基化亚型与CFISH表达水平预测免疫化疗应答及总生存期
Tumor DNA methylation subtypes and expression levels of CFISH predict response and overall survival to immunochemotherapy.
食管癌中，肿瘤DNA甲基化亚型及单核细胞相关CFISH特征与免疫化疗后的总生存期相关。
Nature Genetics数据分析单细胞与空间转录组研究
人胰腺导管腺癌的克隆异质性及其对肿瘤进展的影响
Clonal heterogeneity in human pancreatic ductal adenocarcinoma and its impact on tumor progression.
胰腺导管腺癌中，克隆多样性及MYC扩增与基底样转变、免疫反应程序减弱相关。
预印本实验研究小鼠类器官扰动与机制研究含方法全文
小鼠神经类器官扰动图谱解析大胶质细胞反应性并提出退变驱动因素
A perturbation atlas of mouse neural organoids resolves macroglial reactivity and nominates drivers of degeneration
在小鼠类器官中，单细胞扰动筛选提示gp130-STAT3信号驱动大胶质细胞反应性与感光细胞应激。
预印本方法与工具新算法与基准评测含方法全文
使用 NetMap 同时从头推断细胞类型与基因调控网络
Concurrent de novo inference of cell types and gene regulatory networks with NetMap
提出 NetMap，联合推断细胞级基因调控网络与细胞分群，减少对预先细胞注释的依赖。
Immunity数据分析跨队列单细胞整合分析
全球队列的单细胞分析勾勒免疫衰老的决定因素，并将GZMK+与GZMB+效应记忆T细胞比值与健康轨迹联系起来
Single-cell analyses of global cohorts outline determinants of immune aging and link the ratio of GZMK+ to GZMB+ Tem cells to health trajectories.
GZMK+/GZMB+效应记忆T细胞比值与健康及病理相关衰老轨迹相关。
Cancer Cell数据分析单细胞与空间多组学研究
空间组学解析神经母细胞瘤的肾上腺素能与间充质细胞状态
Spatial omics resolves adrenergic and mesenchymal cell states in neuroblastoma.
多组学识别神经母细胞瘤间充质肿瘤细胞，高间充质基因表达与较差的无事件生存和总生存相关。
Cell Systems数据分析单细胞转录组整合与模型评估
人类早期发育类囊胚模型的系统性转录组评估
Systematic transcriptomic evaluation of blastoid models of early human development.
整合人类囊胚单细胞转录组建立参考图谱，用于评估不同类囊胚模型的细胞谱系保真度。
Cell Genomics数据分析单细胞环境响应eQTL研究
疾病相关位点与常见环境暴露下的响应性 eQTL 具有共同特征
Disease-associated loci share properties with response eQTLs under common environmental exposures.
环境响应性eQTL与疾病风险位点具有相似调控特征，并与部分基线eQTL未能解释的疾病相关位点重合。
Cell Genomics数据分析跨物种单细胞多组学研究
跨9种哺乳动物的单细胞多组学揭示脑内细胞类型特异性调控保守性
Single-cell multiomics across nine mammals reveals cell-type-specific regulatory conservation in the brain.
跨9种哺乳动物的分析揭示细胞类型特异性调控保守性，并发现其与脑疾病遗传风险相关。
Nature Protocols方法与工具逆行示踪结合单细胞测序实验方案
Trace-n-Seq结合逆行荧光示踪、分选与单细胞测序，分析支配组织的外周神经元
Trace-n-Seq combines retrograde fluorescent tracing with sorting and single-cell sequencing of innervating peripheral neurons.
提出Trace-n-Seq，将逆行示踪、细胞分选与单细胞测序结合，解析特定组织的支配神经元。
Cell Genomics方法与工具跨物种单细胞特征提炼方法研究
通过物种间比较提炼骨髓细胞类型特异性转录特征
Concentrating cell-type-specific transcriptional signatures in bone marrow from interspecies comparisons.
提出结合细胞类型特异性与转录水平保守性的策略，提炼可跨物种识别细胞身份的特征基因。