Drugs@FDA 数据文件
FDA 提供 Drugs@FDA 数据库压缩文件下载,每周一至周五早晨更新,供熟悉数据库或电子表格的用户使用。文件解压后包含 12 个文本表,可导入数据库、电子表格或文字处理程序。下载内容不含在线版所用的程序脚本,FDA 不提供数据库设计指导。
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Kong 等利用 HapMap 混合样本和泛基因组图,建立了用于评估体细胞变异检测的标准化基准资源。该资源覆盖不同变异类别和等位基因频率,可用于评估测序技术及变异检出方法。
研究团队构建了涵盖人、猕猴和小鼠24个神经发生谱系的基因调控网络资源,揭示跨物种、跨脑区的时序调控差异。实验为ILF2参与神经发生提供证据,疾病相关基因映射揭示了与30种神经系统疾病及性状相关的调控动态。该资源可通过交互式在线平台免费访问。
研究构建了涵盖22种组织的长期运动多组学图谱,揭示全身转录组、表观遗传、蛋白质组及代谢层面的协同重塑。该图谱刻画了随组织、性别和时间变化的分子适应,以及骨骼肌中细胞类型特异性的表观遗传重塑。
研究者构建MODNAP修饰核苷酸结构数据集,并用1039个核酸及核酸–蛋白质复合物结构评估AlphaFold 3。在RMSD阈值为2.5 Å时,成功率超过80%,但修饰核苷酸定位精度不一,对训练中未明确涵盖的结构精度下降。PoseBusters分析发现频繁的分子内有效性检验失败,主要源于非理想核糖环几何构型。
MassNet汇集涵盖35个物种的1.5 billion条MS/MS谱图,为蛋白质组学深度学习提供大规模AI就绪语料库。该资源配套标准化存储格式Mass Spectrometry DDA Tensor(MSDT)。基于该资源构建的非自回归Transformer模型XuanjiNovo用于肽段从头测序,表现大幅优于既往方法。