复杂神经运动表型患儿基因组测序结果的解读
Friedman等对100个复杂神经运动障碍家庭(108名儿童)开展三联体基因组测序,在53个家庭中发现了导致相应表型的遗传性疾病。除测序结果外,综合利用所有可获得的临床信息,是取得较高诊断率的重要因素。
Friedman等对100个复杂神经运动障碍家庭(108名儿童)开展三联体基因组测序,在53个家庭中发现了导致相应表型的遗传性疾病。除测序结果外,综合利用所有可获得的临床信息,是取得较高诊断率的重要因素。
一项回顾性多数据集基准评测显示,胸片深度学习分类器的源数据概率校准并非均可迁移,区分能力改善也不保证概率校准改善。
研究分析了 467,152 名 UK Biobank 参与者的基因组,绘制全表型结构变异图谱,提示结构变异是此前认识不足的重要疾病风险来源。结构变异指大于 50 个碱基对的 DNA 序列大规模变化,该资源揭示了与疾病相关的罕见及调控性结构变异,为理解人类生物学和药物开发提供线索。
Pan等发现,含四氧烷的化合物WMK-1/2可诱导线粒体脂质过氧化,并在多个体内模型中表现出强效肿瘤抑制活性。此类化合物可绕过GPX4和视黄醇介导的防御,触发一种独特的“线粒体铁死亡”亚通路。
一项针对晚期视网膜色素变性所致失明患者的小规模研究显示,光遗传学疗法似乎安全,初步疗效信号令人鼓舞。研究同时提示该疗法存在技术改进空间,现有结果仍属早期发现。
对336份人类背外侧前额叶皮质样本的分析发现,51,343个短串联重复序列的拷贝数与邻近基因的可变剪接显著相关。研究通过三种精细定位策略筛出1,313个高置信度剪接相关重复序列;共定位分析提示,其中部分可能是阿尔茨海默病、精神分裂症等脑相关疾病的候选因果变异。
基于2171份样本的演化分析显示,NOTCH1突变在正常食管上皮克隆扩增中受到强烈正向选择,但并不驱动既有正常克隆的恶性进展。NOTCH1突变与TP53、RB1突变呈拮抗性上位作用,削弱了肿瘤演化过程中对后两者的选择,提示早期突变的作用取决于疾病阶段与突变背景。
ABCD和AoU人群队列研究显示,罕见蛋白截短变异遗传负荷与认知降低、自闭症谱系障碍、精神分裂症及智力障碍相关。研究纳入3,523名欧洲血统儿童和302,421名欧洲血统成人;儿童每多一个携带此类变异的典型受约束基因,认知低0.22 SD,自闭症谱系障碍OR为1.80。
一项大规模真实世界数据分析发现,癌症免疫治疗期间免疫相关不良事件的发生存在种族差异。这些差异未在临床试验数据中显现,原文将其归因于试验入组患者以白人为主。
细胞自组织通过耦合生化与生物物理特性,使原本各向同性、无边界的铁死亡传播具有方向性并局限于一定范围。局部细胞间相互作用形成决定铁死亡敏感或耐受命运的细胞模式,并建立细胞内脂质的极性组织,揭示了调控集体细胞命运的系统层面机制。
MIMIC-IV队列研究显示,校正时间泄漏后,多模态融合未显著优于结构化EHR单独预测COPD患者30天全因再入院。研究纳入1,279例患者,EHR单独预测的ROC-AUC为0.63,其他模态单独预测为0.46-0.53。重新校准后,融合模型与EHR单独预测的Brier评分无显著差异。
基于EmbryoRadar的大型癌症队列分析显示,早期胚胎基因表达程序广泛存在于人类肿瘤中,其与总生存期的关联因胚胎发育阶段而异。合子及2细胞胚胎阶段的转录相似性与更佳总生存期相关,滋养外胚层相关程序则与乳腺癌和黑色素瘤较差总生存期相关。细胞系依赖性数据提示,MYBL2和FOXM1可能是后类肿瘤的治疗靶点。
Yang等发现,乳酸脱氢酶A(LDHA)依赖的胞质NAD+再生促进HIF1α选择性翻译,支持单核细胞向保护性NOS2+巨噬细胞命运分化。这一发现揭示了氧化还原代谢与细胞命运决定之间的联系。
一项临床前研究显示,携带核心 α(1,3)-岩藻糖的 HIV-1 包膜糖蛋白(Env)免疫原在小鼠中诱导了跨分支中和抗体反应。研究采用 Hi5 昆虫细胞及共表达三种昆虫和植物来源岩藻糖基转移酶的工程化 CHO 细胞制备免疫原,晶体结构显示 Hi5 来源的 BG505 UFO 三聚体保留天然样 Env 架构与表位呈递。
正交Fc工程实现了mRNA编码双特异性抗体的多重递送,以限制病毒逃逸。该研究刊于Science Translational Medicine第18卷第871期,所提供内容未包含具体实验设计或定量结果。
喹啉酸参与适应不良性肾损伤,并促进急性肾损伤向慢性肾脏病转变。相关研究发表于Science Translational Medicine,现有内容未提供研究设计、样本量或具体效应数据。
VG-3927/SAR448851 是一种用于阿尔茨海默病的口服小分子 TREM2 激动剂,研究对其开展了临床前及首次人体评价。该研究刊载于 Science Translational Medicine,所提供内容未披露具体研究设计、样本量或评价结果。
分子胶 RPT04402 可恢复高级别子宫癌中的 PP2A AαB56αC 三聚体形成。该研究发表于 Science Translational Medicine,所提供内容未披露研究设计、样本量或临床疗效数据。
Liang等发现,响应NAD+的脂肪因子Serpina3n可保护骨骼肌,抵御衰老及疾病相关萎缩。NAD+升高通过STAT1促进脂肪组织生成Serpina3n,后者通过丙酮酸羧化酶促进骨骼肌蛋白质稳态和代谢适应,揭示脂肪NAD+代谢与肌肉健康之间的内分泌机制。
Guo等开展的全国多中心登记研究显示,在远端中等血管闭塞所致缺血性卒中患者中,血管内治疗与无残疾比例略高、症状性颅内出血更多相关。结果支持更个体化的获益与风险评估,仍需进一步前瞻性随机研究验证。
英格兰一项纳入1107名原发性线粒体病患者的全国数据关联队列研究显示,遗传诊断后10年生存率为80.3%(95% CI 76.9% to 83.7%),20年为58.9%(95% CI 49.6% to 70.0%)。
Fuchs等在LUD2015-005临床试验中发现,肿瘤DNA甲基化亚型和TMC相关五基因特征CFISH可预测食管癌患者免疫化疗后的总生存期。研究对73例患者的纵向、多部位组织或肿瘤样本进行了全面分子分析,患者在联合治疗前接受了4周免疫治疗预处理。
Costantino等发现,表型测量尺度的选择可改变全基因组关联研究(GWAS)的关联信号及多基因评分(PGS)与环境的交互作用结果。尺度选择还会影响PGS在特定亚组中的表现,但这一影响在现代研究中常被忽视。
该通信关注人类接种rVSVΔG-ZEBOV-GP疫苗后针对本迪布焦病毒(BDBV)的交叉反应性T细胞应答。刚果民主共和国当前BDBV暴发的确诊病例超过6000例,病死率为48%,尚无获批疫苗。rVSVΔG-ZEBOV-GP疫苗(Ervebo)对亲缘相关的埃博拉病毒(EBOV)具有较高保护效力。
Lineage 3 的全球扩张受到本地传播克隆及耐药克隆出现的影响。当前页面正文未能加载,仅凭标题无法确认具体病原体、研究设计、样本量及相关效应量。
肿瘤坏死因子(TNF)损害肠道对胆汁酸的耐受,决定结肠炎进展,并限制英夫利西单抗(infliximab)的治疗应答。该研究发表于Cell Metabolism。
Yao等识别出与胃癌相关、可重复的红细胞全基因组DNA特征,并构建可检出早期胃癌的分类器。该方法使用1–2 mL血液,在三个独立医院队列中表现一致,支持进一步开发用于胃癌无创检测的rbcDNA技术。
JAMA Network Open 发表的一项研究提示,绝经年龄较早可能与认知功能下降更快相关。原文未提供研究样本量、随访时长或关联的具体效应量。
研究利用胰腺导管腺癌肿瘤的单细胞RNA测序和空间转录组学,探究肿瘤异质性与克隆演化,为研究这一侵袭性癌症提供资源。研究在线发表于Nature Genetics,正文未提供具体样本量或主要结果。
癌细胞来源的富马酸抑制肿瘤微环境中CD8+ T细胞的抗肿瘤能力。该研究发表于Cell Metabolism,所提供内容未包含研究设计、样本量或效应量。
Wang等开发口服代谢工程细菌平台EcN-HlpA-CGL [EHC],激活抗肿瘤免疫并有效抑制结直肠癌原位肿瘤生长和转移。该平台诱导癌细胞铁死亡以增强免疫原性,并借助细菌佐剂作用重塑免疫抑制微环境,同时激活全身及肠黏膜免疫。
微核内的 ecDNA 限制肿瘤细胞适应性,并与患者较好的生存结局相关。研究结合癌细胞的单微核测序、活细胞成像及神经母细胞瘤患者活检样本分析,相关结果发表于 Nature Genetics。
研究整合小鼠和人类的八个单细胞或单核RNA测序数据集,构建跨物种脉络丛图谱,识别出涉及离子转运、屏障功能、纤毛发生及分泌信号的保守上皮基因程序。小鼠第四脑室脉络丛Visium HD空间转录组图谱验证了上皮模块;跨组织分析发现,脉络丛与视网膜色素上皮存在显著转录重叠。
Asahina等鉴定出一种驱动过敏性皮炎复发的致病性CXCR6+ CD4+组织驻留记忆T细胞亚群。该亚群通过依赖CXCL16的机制与CD301b+ cDC2聚集并得以维持,提示这一T细胞与树突状细胞生态位可能成为治疗靶点。
研究在三个独立炎症性肠病队列中重复验证,NOD信号通路基因驱动的患者聚类与疾病亚型、克罗恩病行为及手术相关。分析基于全外显子组测序的GenePy评分和K-Means聚类,上述关联主要由NOD2驱动,并提示NLRP1等可能是其他遗传驱动因素。
体内外功能实验表明,衰老癌相关成纤维细胞分泌Tenascin-C(TNC),促进高级别浆液性卵巢癌进展。TNC通过激活肿瘤细胞SDC4-ERK信号诱导上皮间质转化,其表达受成纤维细胞内NF-κB调控。单细胞与空间转录组及临床样本分析构建的衰老成纤维细胞风险模型可预测不良生存结局。
小鼠神经类器官单细胞扰动图谱揭示大胶质细胞的炎症反应状态,并识别出驱动其反应性及光感受器应激的gp130-STAT3信号。类器官覆盖多个脑区与视网膜,在一个月内呈现出生后神经元与大胶质细胞的转录组状态。针对13条Müller胶质细胞特异性通路的筛选显示,特定炎症细胞因子可诱导光感受器退行性变样应激程序。
Klich等利用水凝胶在肿瘤内和肿瘤周围递送免疫治疗组合,合理选择给药部位可促进肿瘤清除并实现长期存活。白细胞介素与OX40激动剂的空间优化定位增强了协同抗肿瘤免疫。
Cabello-Yeves等对母婴配对样本开展纵向宏基因组分析,发现婴儿出生首年肠道噬菌体组逐渐多样化,并与喂养相关变量及母体微生物储库相关。持续存在的双歧杆菌噬菌体在早期群落中占主导,提示噬菌体可能与生命早期靶向微生物组的干预有关。
文章标题显示,整合单细胞组学与生物样本库数据发现了近100个基因在脂肪细胞中表达的等位基因特异性效应。正文仅显示网站加载失败提示,无法核实研究设计、样本量及具体结果。