早期NOTCH1突变受到正向选择,但通过上位性作用抑制后续食管鳞状细胞癌驱动突变的演化
基于2171份样本的演化分析显示,NOTCH1突变在正常食管上皮克隆扩增中受到强烈正向选择,但并不驱动既有正常克隆的恶性进展。NOTCH1突变与TP53、RB1突变呈拮抗性上位作用,削弱了肿瘤演化过程中对后两者的选择,提示早期突变的作用取决于疾病阶段与突变背景。
基于2171份样本的演化分析显示,NOTCH1突变在正常食管上皮克隆扩增中受到强烈正向选择,但并不驱动既有正常克隆的恶性进展。NOTCH1突变与TP53、RB1突变呈拮抗性上位作用,削弱了肿瘤演化过程中对后两者的选择,提示早期突变的作用取决于疾病阶段与突变背景。
一项临床前研究显示,携带核心 α(1,3)-岩藻糖的 HIV-1 包膜糖蛋白(Env)免疫原在小鼠中诱导了跨分支中和抗体反应。研究采用 Hi5 昆虫细胞及共表达三种昆虫和植物来源岩藻糖基转移酶的工程化 CHO 细胞制备免疫原,晶体结构显示 Hi5 来源的 BG505 UFO 三聚体保留天然样 Env 架构与表位呈递。
研究利用胰腺导管腺癌肿瘤的单细胞RNA测序和空间转录组学,探究肿瘤异质性与克隆演化,为研究这一侵袭性癌症提供资源。研究在线发表于Nature Genetics,正文未提供具体样本量或主要结果。
研究整合小鼠和人类的八个单细胞或单核RNA测序数据集,构建跨物种脉络丛图谱,识别出涉及离子转运、屏障功能、纤毛发生及分泌信号的保守上皮基因程序。小鼠第四脑室脉络丛Visium HD空间转录组图谱验证了上皮模块;跨组织分析发现,脉络丛与视网膜色素上皮存在显著转录重叠。
体内外功能实验表明,衰老癌相关成纤维细胞分泌Tenascin-C(TNC),促进高级别浆液性卵巢癌进展。TNC通过激活肿瘤细胞SDC4-ERK信号诱导上皮间质转化,其表达受成纤维细胞内NF-κB调控。单细胞与空间转录组及临床样本分析构建的衰老成纤维细胞风险模型可预测不良生存结局。
小鼠神经类器官单细胞扰动图谱揭示大胶质细胞的炎症反应状态,并识别出驱动其反应性及光感受器应激的gp130-STAT3信号。类器官覆盖多个脑区与视网膜,在一个月内呈现出生后神经元与大胶质细胞的转录组状态。针对13条Müller胶质细胞特异性通路的筛选显示,特定炎症细胞因子可诱导光感受器退行性变样应激程序。
文章标题显示,整合单细胞组学与生物样本库数据发现了近100个基因在脂肪细胞中表达的等位基因特异性效应。正文仅显示网站加载失败提示,无法核实研究设计、样本量及具体结果。
Terekhova等通过全球队列单细胞分析发现,CD8+ Tem细胞中GZMK+与GZMB+的比值可区分健康与疾病相关衰老轨迹,并预测死亡风险。研究整合8个数据集、2,609名个体及超过1200万个细胞,构建PBMC图谱,解析人类免疫衰老的可变与保守特征。
Patel等在54例神经母细胞瘤肿瘤中识别出间充质(MES)肿瘤细胞,并发现较高MES评分可预测较差的患者结局。研究结合六种空间组学平台与单细胞/单核RNA测序,利用患者来源异种移植模型的特征识别MES肿瘤细胞。
Anderson等比较九种哺乳动物的脑基因调控,发现增强子的保守性不仅体现于DNA序列,还涉及细胞类型特异性和靶基因。功能实验显示,古老及人类特异性调控元件均参与塑造脑生物学特征与神经系统疾病易感性。