肺组织空间图谱揭示重症COVID-19肺损伤与纤维化的细胞机制
IR Sant Pau参与的研究绘制了致死性COVID-19肺组织空间图谱，发现肺损伤进展伴随细胞组成及通讯重塑。研究发表于Nature Communications，分析19例死者肺组织，发现增生性弥漫性肺泡损伤中SMAD3活性升高、SMAD7活性降低，与促纤维化信号相关；肺泡上皮再生程序仍活跃，但可能不完整。
#空间组学
Medical XpressAI 评分4545
Nature GeneticsAI 评分3434 人胰腺导管腺癌的克隆异质性及其对肿瘤进展的影响
研究利用胰腺导管腺癌肿瘤的单细胞RNA测序和空间转录组学，探究肿瘤异质性与克隆演化，为研究这一侵袭性癌症提供资源。研究在线发表于Nature Genetics，正文未提供具体样本量或主要结果。
预印本 · 单细胞与空间组学AI 评分3535 脉络丛整合多组学图谱揭示上皮功能的保守分子程序
研究整合小鼠和人类的八个单细胞或单核RNA测序数据集，构建跨物种脉络丛图谱，识别出涉及离子转运、屏障功能、纤毛发生及分泌信号的保守上皮基因程序。小鼠第四脑室脉络丛Visium HD空间转录组图谱验证了上皮模块；跨组织分析发现，脉络丛与视网膜色素上皮存在显著转录重叠。
Genome MedicineAI 评分3939 衰老癌相关成纤维细胞分泌Tenascin-C促进高级别浆液性卵巢癌进展
体内外功能实验表明，衰老癌相关成纤维细胞分泌Tenascin-C（TNC），促进高级别浆液性卵巢癌进展。TNC通过激活肿瘤细胞SDC4-ERK信号诱导上皮间质转化，其表达受成纤维细胞内NF-κB调控。单细胞与空间转录组及临床样本分析构建的衰老成纤维细胞风险模型可预测不良生存结局。
Cancer CellAI 评分4242 空间组学解析神经母细胞瘤的肾上腺素能与间充质细胞状态
Patel等在54例神经母细胞瘤肿瘤中识别出间充质（MES）肿瘤细胞，并发现较高MES评分可预测较差的患者结局。研究结合六种空间组学平台与单细胞/单核RNA测序，利用患者来源异种移植模型的特征识别MES肿瘤细胞。