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今天10月17日周六2 条
  1. Medical Xpress46

    前列腺癌基因组驱动变异研究揭示部分肿瘤侵袭性增强的新线索

    OICR与哥本哈根大学共同牵头的研究发现,前列腺癌存在四种基因组亚型,其中两种与较高转移风险相关。研究发表于Nature Communications,分析近1,000个肿瘤的全基因组数据,97%的肿瘤携带至少一种已知或潜在驱动变异。近四分之一肿瘤存在现有抗癌药物的潜在靶点,临床应用仍需验证。

10月16日周五
  1. Genome Medicine55

    中国128家遗传实验室研究发现,多疾病相关基因的疾病特异性解读是变异分类分歧的重要来源

    一项纳入中国128家临床遗传实验室的研究发现,13个胚系变异中仅6个获得总体分类一致,7个存在具有临床意义的跨类别分歧。研究采用涵盖五种临床情境的能力验证数据,发现实验室对APOB、LZTR1、MYH7和EPCAM变异常跨疾病沿用致病性判定,未充分考虑疾病机制、遗传模式或疾病特异性有效性,而两个GJB2变异的分类一致性明显较高。

10月15日周四
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学32

    自杀、双相障碍与重性抑郁障碍中共有及特异的转录特征

    一项系统综述整合人类死后脑组织转录组数据,发现自杀、双相障碍与重性抑郁障碍共有276个差异表达基因,同时存在疾病及脑区特异性特征。共有基因涉及细胞应激、缺氧、免疫炎症及补体激活等通路。自杀相关差异表达基因以下调为主,涉及金属离子稳态、应激反应、突触调节及昼夜节律通路。

  2. Cell · In Press55

    467,152 名 UK Biobank 参与者的基因组分析绘制全表型结构变异图谱

    研究分析了 467,152 名 UK Biobank 参与者的基因组,绘制全表型结构变异图谱,提示结构变异是此前认识不足的重要疾病风险来源。结构变异指大于 50 个碱基对的 DNA 序列大规模变化,该资源揭示了与疾病相关的罕见及调控性结构变异,为理解人类生物学和药物开发提供线索。

  3. Genome Biology45

    短串联重复序列对人类前额叶皮质剪接变异的贡献

    对336份人类背外侧前额叶皮质样本的分析发现,51,343个短串联重复序列的拷贝数与邻近基因的可变剪接显著相关。研究通过三种精细定位策略筛出1,313个高置信度剪接相关重复序列;共定位分析提示,其中部分可能是阿尔茨海默病、精神分裂症等脑相关疾病的候选因果变异。

  4. Genome Medicine47

    早期NOTCH1突变受到正向选择,但通过上位性作用抑制后续食管鳞状细胞癌驱动突变的演化

    基于2171份样本的演化分析显示,NOTCH1突变在正常食管上皮克隆扩增中受到强烈正向选择,但并不驱动既有正常克隆的恶性进展。NOTCH1突变与TP53、RB1突变呈拮抗性上位作用,削弱了肿瘤演化过程中对后两者的选择,提示早期突变的作用取决于疾病阶段与突变背景。

  5. 预印本 · 医学生信与数据分析49

    人群队列中全外显子组罕见变异遗传负荷与认知、智力障碍及精神障碍相关

    ABCD和AoU人群队列研究显示,罕见蛋白截短变异遗传负荷与认知降低、自闭症谱系障碍、精神分裂症及智力障碍相关。研究纳入3,523名欧洲血统儿童和302,421名欧洲血统成人;儿童每多一个携带此类变异的典型受约束基因,认知低0.22 SD,自闭症谱系障碍OR为1.80。

10月14日周三
10月13日周二
10月12日周一
  1. 预印本 · 医学生信与数据分析40

    基于遗传信息的患者聚类特征分析揭示炎症性肠病的遗传异质性

    研究在三个独立炎症性肠病队列中重复验证,NOD信号通路基因驱动的患者聚类与疾病亚型、克罗恩病行为及手术相关。分析基于全外显子组测序的GenePy评分和K-Means聚类,上述关联主要由NOD2驱动,并提示NLRP1等可能是其他遗传驱动因素。

10月9日周五
  1. Cell Reports Medicine34

    母乳喂养及母体微生物储库与婴儿出生首年肠道噬菌体组发育相关

    Cabello-Yeves等对母婴配对样本开展纵向宏基因组分析,发现婴儿出生首年肠道噬菌体组逐渐多样化,并与喂养相关变量及母体微生物储库相关。持续存在的双歧杆菌噬菌体在早期群落中占主导,提示噬菌体可能与生命早期靶向微生物组的干预有关。

10月8日周四
9月29日周二