Cell Reports Medicine方法与工具抗体与免疫检测方法开发
抗 HDGFL2 隐蔽蛋白抗体可灵敏反映 TDP-43 病理及临床疾病特征
Anti-HDGFL2 cryptic protein antibodies provide a sensitive readout of TDP-43 pathology and clinical disease features.
开发抗 HDGFL2-CE 抗体与灵敏免疫检测方法，用于反映 TDP-43 功能障碍及相关疾病特征。
文献解读
从数据分析和研究设计的角度读新论文：数据从哪来、流程怎么走、用了什么工具、哪里值得学。
Immunity数据分析跨队列单细胞整合分析
全球队列的单细胞分析勾勒免疫衰老的决定因素，并将GZMK+与GZMB+效应记忆T细胞比值与健康轨迹联系起来
Single-cell analyses of global cohorts outline determinants of immune aging and link the ratio of GZMK+ to GZMB+ Tem cells to health trajectories.
GZMK+/GZMB+效应记忆T细胞比值与健康及病理相关衰老轨迹相关。
Bioinformatics方法与工具开源工具开发与工作流演示
hpci 通过整合持续集成与高性能计算集群提高计算生物学研究的可重复性
hpci improves reproducibility of computational biology research by integrating Continuous Integration with High Performance Computing clusters.
开发了 hpci，连接持续集成平台与高性能计算集群，支持分析工作流的自动化测试。
Cell Reports Medicine数据分析纵向宏基因组研究
母乳喂养及母体微生物储库与婴儿出生后第一年肠道噬菌体组发育相关
Breastfeeding and maternal microbial reservoirs are associated with infant gut phageome development during the first year of life.
婴儿肠道噬菌体多样性随年龄增加，喂养相关变量与特定发育阶段的噬菌体组组成相关。
Cell Reports Medicine实验研究肿瘤模型局部免疫治疗研究
对白细胞介素与 OX40 激动剂进行空间定位调控可增强协同抗肿瘤免疫
Spatially tuned localization of interleukins and OX40 agonists enhances synergistic anti-tumor immunity.
在小鼠肿瘤模型中，水凝胶介导的细胞因子与 OX40 激动剂空间定位给药增强了协同抗肿瘤疗效。
Immunity实验研究小鼠模型机制研究
小胶质细胞介导的细胞外基质破坏驱动酒精滥用后的神经元功能障碍、运动障碍和镇静
Microglia-mediated extracellular matrix disruption drives neuronal dysfunction, motor impairments, and sedation following alcohol abuse.
在小鼠中，小胶质细胞介导的细胞外基质破坏驱动酒精相关神经损伤，敲除其Myd88具有保护作用。
Cancer Cell数据分析单细胞与空间多组学研究
空间组学解析神经母细胞瘤的肾上腺素能与间充质细胞状态
Spatial omics resolves adrenergic and mesenchymal cell states in neuroblastoma.
多组学识别神经母细胞瘤间充质肿瘤细胞，高间充质基因表达与较差的无事件生存和总生存相关。
Bioinformatics方法与工具新方法与模拟评估
FA-MFMR：通过因子增强处理相关纵向暴露的多变量函数型孟德尔随机化方法
FA-MFMR: a multivariable functional Mendelian randomization method that accounts for correlated longitudinal exposures via factor augmentation.
提出 FA-MFMR，用于估计多个相关纵向暴露的时变因果效应，并改善估计稳定性。
Bioinformatics方法与工具解码算法开发与基准评测
Serval：用于解码基于成像的空间转录组数据的模块化框架
Serval: a modular framework for decoding imaging based spatial transcriptomics data.
提出模块化解码框架 Serval 及 CoSiD 算法，支持跨平台基准评测并提高转录本检出。
Bioinformatics方法与工具软件库开发与基准评测
BioForge：用 Rust 编写的快速、安全的大分子结构准备库
BioForge: a fast and safe macromolecular structure preparation library in Rust.
提出 BioForge，为大分子结构提供不依赖特定力场的预处理，并支持浏览器部署和流程嵌入。
Cell Metabolism临床研究设计多中心随机对照试验（II 期）
新型 GLP-1、GIP 和胰高血糖素受体三重激动剂 UBT251 用于超重或肥胖成人：一项多中心随机 II 期临床试验
UBT251, a novel triple GLP-1, GIP, and glucagon receptor agonist, in adults with overweight or obesity: A multicenter, randomized phase 2 trial.
24 周随机试验中，UBT251 较安慰剂减重更多，并改善心血管代谢指标，最常见不良事件为胃肠道症状。
Cancer Cell数据分析研究评述
染色质可塑性与谱系重用：当胃细胞身份转向酸性
Chromatin plasticity and lineage repurposing: When gastric identity turns acidic.
评述癌前染色质状态与伪胃型亚型的发现，提示胃质子泵可能成为治疗靶点。
Cell Metabolism实验研究巨噬细胞表观遗传机制研究
组蛋白乳酰化瘢痕沿肠-肝轴传递代谢与表观遗传记忆
Histone lactylation scarring transmits metabolic and epigenetic memory across the gut-liver axis.
实验模型中，结肠炎消退后持续存在的巨噬细胞记忆通过肠-肝迁移增强后续脂肪变性。
The Lancet Oncology临床研究设计多中心单臂II期临床试验
尼拉帕利单药新辅助治疗不可切除、同源重组缺陷阳性高级别浆液性卵巢癌（NANT）：一项多中心、单臂II期临床试验
Neoadjuvant niraparib monotherapy for unresectable, homologous recombination deficiency-positive, high-grade serous ovarian cancer (NANT): a multicentre, single-arm, phase 2 trial.
尼拉帕利新辅助单药在部分HRD阳性晚期卵巢癌患者中显示抗肿瘤活性，仍需随机验证。
Nature Cancer实验研究小鼠模型与多组学机制研究
肠上皮GSK3β调控富马酸依赖性中性粒细胞重编程，促进结直肠癌
Intestinal epithelial GSK3β governs fumarate-dependent neutrophil reprogramming to promote colorectal cancer.
在小鼠模型中，肠上皮GSK3β通过富马酸依赖性重编程促进免疫抑制性中性粒细胞极化。
Cancer Cell数据分析染色质可及性图谱与机制研究
染色质可及性轨迹揭示癌前表观遗传预激及酸驱动的免疫治疗耐药胃癌亚型
Chromatin accessibility trajectories reveal pre-cancerous epigenetic priming and an acid-driven immunotherapy-resistant gastric cancer subtype.
胃癌染色质可及性图谱揭示癌前预激状态，并识别出与免疫治疗耐药相关的拟胃型亚型。
Bioinformatics方法与工具新工具开发与基准评测
STiLE：用于空间转录组学的自动化组织微阵列拆分工具
STiLE: automated tissue microarray dearraying for spatial transcriptomics.
提出仅依赖细胞质心坐标的STiLE，自动将空间转录组组织微阵列中的细胞分配至各组织芯。
Nature Protocols方法与工具免疫监测方法综述
T细胞免疫监测：定量与表征人抗原特异性T细胞的传统及新兴方法比较分析
T cell immunomonitoring: a comparative analysis of traditional and novel methods to quantify and characterize human antigen-specific T cells.
综述抗原特异性T细胞免疫监测技术，讨论方法互补、检测标准化及样本处理的重要性。
Bioinformatics方法与工具分子生成方法与基准评测
结合口袋对比学习与构象融合，实现受体构象变化下稳健的结构条件化3D分子生成
Pocket contrastive learning and conformation fusion for robust structure-conditioned 3D molecular generation under receptor conformational variation.
提出结合口袋对比学习与参考构象特征融合的3D分子生成框架，提高受体构象变化下的稳健性。
Cell Genomics方法与工具宏基因组模拟工具与基准评测
RandomReadsMG：用于基准评测与实验设计的快速、逼真的太碱基规模宏基因组模拟
RandomReadsMG: Rapid, realistic metagenome simulation at terabase scale for benchmarking and experimental design.
提出 RandomReadsMG，快速生成逼真的大规模宏基因组模拟数据，用于基准评测与研究设计。