Cell Metabolism实验研究真菌代谢物促肝癌机制研究
少根根霉通过生成犬尿喹啉酸促进MASLD相关肝细胞癌
Fungus Rhizopus arrhizus promotes MASLD-associated hepatocellular carcinoma through generating kynurenic acid.
在小鼠和细胞模型中，少根根霉产生的犬尿喹啉酸通过IQGAP1–MAPK信号促进MASLD相关肝癌。
文献解读
从数据分析和研究设计的角度读新论文：数据从哪来、流程怎么走、用了什么工具、哪里值得学。
Cell Systems数据分析单细胞转录组整合与模型评估
人类早期发育类囊胚模型的系统性转录组评估
Systematic transcriptomic evaluation of blastoid models of early human development.
整合人类囊胚单细胞转录组建立参考图谱，用于评估不同类囊胚模型的细胞谱系保真度。
Cell Systems方法与工具贝叶斯方法开发与基准评测
FLIGHTED：从含噪声的高通量实验数据推断适应度景观
FLIGHTED: Inferring fitness landscapes from noisy high-throughput experimental data.
提出 FLIGHTED，从含噪声的高通量实验构建概率性适应度景观，改善蛋白质适应度模型性能。
Immunity实验研究细胞治疗衰老机制研究
葡萄糖匮乏的肿瘤微环境激活 AMP 活化蛋白激酶，驱动过继转移的辅助性 T 细胞 9 衰老
Glucose-deprived tumor microenvironment activates AMP-activated protein kinase to drive adoptively transferred T helper 9 cell senescence.
在细胞模型中，葡萄糖匮乏通过 AMPK–ZAK–NIK 通路驱动 Th9 细胞衰老，靶向 ZAK 可改善其功能。
Cell Genomics数据分析单细胞环境响应eQTL研究
疾病相关位点与常见环境暴露下的响应性 eQTL 具有共同特征
Disease-associated loci share properties with response eQTLs under common environmental exposures.
环境响应性eQTL与疾病风险位点具有相似调控特征，并与部分基线eQTL未能解释的疾病相关位点重合。
Cell Genomics数据分析跨物种单细胞多组学研究
跨9种哺乳动物的单细胞多组学揭示脑内细胞类型特异性调控保守性
Single-cell multiomics across nine mammals reveals cell-type-specific regulatory conservation in the brain.
跨9种哺乳动物的分析揭示细胞类型特异性调控保守性，并发现其与脑疾病遗传风险相关。
Nature Cancer方法与工具复杂突变现象术语综述
厘清人类癌症中复杂突变现象的术语体系
Unraveling the lexicon of complex mutational phenomena in human cancers.
梳理癌症复杂突变现象的术语体系，厘清定义与机制歧义及其临床关联。
Nature Protocols方法与工具抗纤维化药物筛选实验方案
新方法学：用于鉴定抗纤维化化合物的药物筛选平台
New approach methodologies: drug screening platform to identify antifibrotic compounds.
提出基于人iPS细胞的药物筛选平台，结合抗纤维化初筛与心脏毒性反筛。
Nature Protocols方法与工具类器官技术教程与综述
教程：利用类器官技术探究生物学问题
Tutorial: interrogating biology using organoid technologies.
介绍类器官技术与实验方案，梳理其在生物学和转化研究中的应用及模型选择。
Nature Protocols方法与工具显微成像软件平台与分析流程
SIMworks：用于质量受控的增强定量结构光照明显微成像的集成软件套件
SIMworks-an integrated software suite for quality-controlled augmented quantitative structured illumination microscopy.
开发了SIMworks，整合SIM数据的质量控制、处理与定量分析，降低分析门槛并提升数据可靠性。
Cell Systems实验研究细胞模型机制研究
CRISPR 相关酶在 iPSC 来源神经元中错误定位于细胞质，导致 KRAB(KOX1) 特异性降解
CRISPR-associated enzymes are mislocalized to the cytoplasm in iPSC-derived neurons, resulting in KRAB(KOX1)-specific degradation.
在 iPSC 来源神经元中，核定位异常导致 KRAB(KOX1) 特异性降解，更换核定位信号可恢复表达。
Nature Protocols方法与工具逆行示踪结合单细胞测序实验方案
Trace-n-Seq结合逆行荧光示踪、分选与单细胞测序，分析支配组织的外周神经元
Trace-n-Seq combines retrograde fluorescent tracing with sorting and single-cell sequencing of innervating peripheral neurons.
提出Trace-n-Seq，将逆行示踪、细胞分选与单细胞测序结合，解析特定组织的支配神经元。
Nature Protocols方法与工具组织膨胀质谱成像实验方案
用于高空间分辨率多组学分子图谱绘制的组织膨胀质谱成像（TEMI）
Tissue expansion mass spectrometry imaging (TEMI) for high-spatial-resolution multiomics molecular mapping.
提供TEMI实验方案，通过组织物理膨胀提升常规质谱成像分辨率，实现单张组织切片的多组学分子定位。
Cell Genomics方法与工具跨物种单细胞特征提炼方法研究
通过物种间比较提炼骨髓细胞类型特异性转录特征
Concentrating cell-type-specific transcriptional signatures in bone marrow from interspecies comparisons.
提出结合细胞类型特异性与转录水平保守性的策略，提炼可跨物种识别细胞身份的特征基因。
Med临床研究设计临床叙述性综述
妊娠相关心脏并发症
Pregnancy-associated cardiac complications.
综述围产期常见心脏疾病及其管理，强调多学科心脏病学与产科学团队协作。
Med数据分析深度学习筛查模型开发与外部验证
基于超声心动图的深度学习慢性肾脏病筛查
Deep learning-enabled screening of chronic kidney disease from echocardiography.
超声心动图深度学习模型可识别慢性肾脏病，在两个独立外部队列中保持稳健表现。
Med实验研究蛋白工程与临床前及首次人体研究
用于干眼病的黏膜黏附性重组人过氧化氢酶：从蛋白质工程到首次人体研究
Mucoadhesive recombinant human catalase for dry eye disease: From protein engineering to first-in-human study.
hCAT-SH在小鼠中改善干眼表型，并在首次人体试验中改善角膜荧光素染色，支持进一步开发。
Nature方法与工具病理切缘自动标注模型研究
利用基础模型自主标注手术切除标本切缘
Autonomous labeling of surgical resection margins using a foundation model.
提出虚拟染墨网络VIN，在全切片图像上自动定位手术切面，减少对实体染墨的依赖。