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10月15日周四
  1. 预印本 · 医学生信与数据分析49

    早期胚胎基因表达程序广泛存在于癌症中,与生存的关联因胚胎发育阶段而异

    基于EmbryoRadar的大型癌症队列分析显示,早期胚胎基因表达程序广泛存在于人类肿瘤中,其与总生存期的关联因胚胎发育阶段而异。合子及2细胞胚胎阶段的转录相似性与更佳总生存期相关,滋养外胚层相关程序则与乳腺癌和黑色素瘤较差总生存期相关。细胞系依赖性数据提示,MYBL2和FOXM1可能是后类肿瘤的治疗靶点。

  2. 预印本 · 医学生信与数据分析36

    CytoLens:用于定量宫颈细胞学分析的模块化深度学习系统

    CytoLens在任务匹配的公共数据集上完成训练与测试,可检测细胞核、分割细胞并进行分类,细胞核检测F1为0.931(95% CI 0.914–0.946)。四类细胞分类的平均准确率为0.947,异常候选细胞评分的AUROC为0.865。结果支持进一步在关联患者信息的临床标本上评估该系统。

  3. 预印本 · 单细胞与空间组学49

    非外显子读段含量重塑肾癌及其他癌症的 lncRNA 共表达网络

    肾癌队列(1,062例患者)中,lncRNA主要共表达轴与非外显子读段比例高度相关(Spearman rho 0.90),未校正时多数网络合并为单一模块。25种TCGA癌症中,9种存在lncRNA特异性轴,4种出现网络塌缩。校正后保留的肾癌模块未在TNM和分级基础上增加判别能力。

  4. 预印本 · 单细胞与空间组学51

    HIV-1 Env 异源糖基化免疫原在小鼠中诱导跨分支中和反应

    一项临床前研究显示,携带核心 α(1,3)-岩藻糖的 HIV-1 包膜糖蛋白(Env)免疫原在小鼠中诱导了跨分支中和抗体反应。研究采用 Hi5 昆虫细胞及共表达三种昆虫和植物来源岩藻糖基转移酶的工程化 CHO 细胞制备免疫原,晶体结构显示 Hi5 来源的 BG505 UFO 三聚体保留天然样 Env 架构与表位呈递。

  5. Nucleic Acids Research50

    用于核糖型修饰核酸及核酸–蛋白质复合物建模的MODNAP基准集:以AlphaFold 3为例

    研究者构建MODNAP修饰核苷酸结构数据集,并用1039个核酸及核酸–蛋白质复合物结构评估AlphaFold 3。在RMSD阈值为2.5 Å时,成功率超过80%,但修饰核苷酸定位精度不一,对训练中未明确涵盖的结构精度下降。PoseBusters分析发现频繁的分子内有效性检验失败,主要源于非理想核糖环几何构型。

  6. 预印本 · 医学生信与数据分析45

    人类基底前脑亚系统在衰老及神经精神疾病中的选择性易损性

    一项纳入81,870名UK Biobank参与者的研究发现,基底前脑结构异常主要集中于Ch4,而非Ch1-3。研究为45-87岁人群建立年龄和性别特异性灰质体积常模,纵向数据支持两区域存在不同的年龄相关变化。Ch4体积缺损在确诊前数年即可检出,与新发痴呆和帕金森病相关,且不能主要由常见遗传风险解释。

  7. The Lancet Infectious Diseases11

    The Lancet Infectious Diseases 更正:BPZE1 百日咳疫苗 IIb 期临床试验补充 SUPER Trial 研究者及所属机构名单

    The Lancet Infectious Diseases 为 BPZE1 鼻内减毒活百日咳疫苗研究补充了 SUPER Trial 研究者及其所属机构名单。该研究为随机、活性对照及安慰剂对照的 IIb 期临床试验,在6–17岁健康儿童中评估该疫苗单用或联合破伤风、减量白喉和无细胞百日咳疫苗的免疫原性与安全性。

10月14日周三
  1. FDA Press Releases80

    FDA 扩大 Anktiva 联合 BCG 适应症,用于 BCG 无应答的高分级单纯乳头状膀胱癌

    FDA 批准扩大 Anktiva(nogapendekin alfa inbakicept-pmln)联合卡介苗(BCG)的适用范围,用于 BCG 治疗无应答的高分级单纯乳头状非肌层浸润性膀胱癌成人患者。

    推荐理由:此次适应症扩展依据原位癌试验结果及两类肿瘤的科学相似性,有助于理解相关膀胱癌亚型之间的证据外推依据。

  2. KFF Health News44

    加州亿万富翁税提案承诺缓解医疗资金压力,具体条款仍存疑

    加州Proposition 40拟向亿万富翁一次性征税以弥补医疗资金削减,但筹资规模、到账时间及具体用途仍不明确。提案拟对约200名净资产至少10亿美元的居民征收5%税款,将90%收入用于医疗,尚待11月选民表决。即使获通过,资金也至少需数月才能到位,医疗界担忧一次性收入难以提供持续支持。

  3. KFF Health News35

    老年生活照护管理师可成为家庭的“救星”

    老年生活照护管理师为老年人及其家庭协调就医、搬迁和照护安排,帮助应对照护危机,但不直接提供日常照护。他们独立受雇于客户及家庭,行业协会伦理准则禁止收取转介费或回扣。协会成员每小时收费为$150至$350,部分城市的社会服务机构按支付能力分级收费。

  4. Science Translational Medicine5

    预防胜于治疗

    Science Translational Medicine刊载题为“预防胜于治疗”的文章,收录于第18卷第871期。所提供材料仅含书目信息,未提供具体预防措施、研究设计或临床结果。

  5. Bioinformatics (OUP)51

    CRISPR-HAWK 将单倍型与遗传变异纳入 CRISPR-Cas 向导 RNA 设计

    CRISPR-HAWK 将个体及群体层面的遗传变异与单倍型整合进向导 RNA(gRNA)设计,以补充依赖参考基因组的设计方法。对 79 648 个基因组的分析发现,七个治疗靶位点中 82.5% 的向导含有影响靶向活性的变异;针对已获临床批准的镰状细胞病疗法所用 BCL11A 向导,研究识别出使预测切割活性完全丧失的单倍型。

  6. Nucleic Acids Research42

    RiboBA:一种考虑偏倚的概率框架,用于跨多种核糖体测序方案稳健识别ORF

    RiboBA通过建模核糖体测序中的实验方案诱导偏倚,提高非经典开放阅读框(ncORF)的识别能力。该框架结合生成模块与监督模块,从偏倚校正后的数据中识别翻译中的ORF及起始位点。模拟、多种实测数据及正交免疫肽组学证据支持其性能,优势在周期性减弱的RNase I文库及MNase、核酸酶P1数据中尤为明显。